El Día de la Prefectura Naval Argentina se celebra cada 30 de junio en conmemoración de la designación del Coronel Martín Jacobo Thompson como primer Capitán de Puerto de las Provincias Unidas del Río de la Plata el en 1810, que también sirvió como acta oficial de nacimiento de la institución.
El Día de la Prefectura Naval Argentina tiene su origen en la junta de gobierno formada tras la Revolución de Mayo de 1810 en el marco de la Guerra de Independencia, cuando las autoridades de las Provincias Unidas de Río de la Plata establecieron la estructura del nuevo gobierno. El 25 de junio de 1810 se decretó la subordinación de la Capitanía de Puerto al primer gobierno patrio, rechazando la autoridad de la comandancia de la marina española de Montevideo. El 30 de junio fue designado el Coronel de Marina Martín Jacobo Thompson como Capitán de Puertos, mediante decreto redactado de puño y letra por el secretario de Gobierno y Guerra, Mariano Moreno. La Capitanía de Puertos tendría jurisdicción sobre todas las vías navegables interiores y del mar Argentino.
