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jueves, 1 diciembre, 2022
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    Covid: monitoreo en tiempo real para frenar la circulación de nuevas cepas

    El Proyecto Argentino Interinstitucional de Genómica del Sars-Cov-2 (Pais) detectó hasta el momento las variantes de Reino Unido y de Manaos y Río de Janeiro, Brasil

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    Como si fuera poco un año de pandemia que no tiene mayor certidumbre que la necesidad de extremar la higiene y cumplir con el distanciamiento social, ahora el temor ante el avamce de las variantes del Sars-Cov-2 se posiciona en la agenda sanitaria.

    Las variantes del Covid-19 y el riesgo de desarrollar cuadros graves representa una preocupación para las autoridades, los científicos y la población en general, sobre todo en aquellos que contrajeron y superaron el virus. Y en ese contexto, los países limítrofes como Brasil y Paraguay, donde sus sistemas sanitarios están desbordados, son sinónimo de amenaza para una provincia como Misiones con 90% de frontera.

    Las mutaciones del virus registradas en Manaos y en Río de Janeiro ya están en Argentina. Si bien son casos importados, lo cierto es que hubo notificaciones en Buenos Aires y recientemente en Córdoba, mientras que Entre Ríos, Corrientes y Misiones son algunas de las provincias que esperan los resultados de las muestras enviadas al Instituto Malbrán para descartar mutaciones o variantes del virus. En lo que respecta a la provincia, el Laboratorio de Alta Complejidad de Misiones (Lacmi) envió hisopados de dos pacientes infectados de Covid que volvieron del extranjero.

    El escenario parece  desalentador, en tanto los científicos trabajan en la vigilancia epidemiológica. Más que nunca: detectar y aislar para evitar la circulación de variantes o bien lo que es aún peor, una nueva cepa.

    En ese contexto, es clave el rol que desempeña del Proyecto Argentino Interinstitucional de Genómica del Sars-Cov-2 (Pais), del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación, que desde fines del año pasado reforzó la orientación de su trabajo hacia la vigilancia genómica de variantes que pudieran estar circulando en Argentina.

    Las variantes del Covid-19 y el riesgo de desarrollar cuadros graves representa una preocupación para las autoridades, los científicos y la población en general, sobre todo en aquellos que contrajeron y superaron el virus. Y en ese contexto, los países limítrofes como Brasil y Paraguay, donde sus sistemas sanitarios están desbordados, son sinónimo de amenaza para una provincia como Misiones con 90% de frontera.

    Las mutaciones del virus registradas en Manaos y en Río de Janeiro ya están en Argentina. Si bien son casos importados, lo cierto es que hubo notificaciones en Buenos Aires y recientemente en Córdoba, mientras que Entre Ríos, Corrientes y Misiones son algunas de las provincias que esperan los resultados de las muestras enviadas al Instituto Malbrán para descartar mutaciones o variantes del virus. En lo que respecta a la provincia, el Laboratorio de Alta Complejidad de Misiones (Lacmi) envió hisopados de dos pacientes infectados de Covid que volvieron del extranjero.

    El escenario parece  desalentador, en tanto los científicos trabajan en la vigilancia epidemiológica. Más que nunca: detectar y aislar para evitar la circulación de variantes o bien lo que es aún peor, una nueva cepa.

    En ese contexto, es clave el rol que desempeña del Proyecto Argentino Interinstitucional de Genómica del Sars-Cov-2 (Pais), del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación, que desde fines del año pasado reforzó la orientación de su trabajo hacia la vigilancia genómica de variantes que pudieran estar circulando en Argentina.

    “La aparición de estas dos muestras  sin nexo epidemiológico podrían significar que la variante de Reino Unido podría estar circulando en el Amba”, asevero.

    “En cuanto a la variante de Manaos, el consorcio Pais ha detectado tres muestras, todas correspondientes a viajeros, dos de Buenos Aires, y una en Córdoba; otras dos fueron detectadas por el Malbrán. Con respecto a la tercera variante de preocupación, que es la variante de Sudáfrica, no tenemos registro. También el consorcio ha detectado 44 muestras compatibles con la variante de Río de Janeiro, no es una variante de preocupación pero sí una variante de interés. Asimismo hemos identificado siete muestras compatible con una variante de California, que recientemente fue clasificada por el CDC como preocupante ya que sería un 20% más transmisible y tendría un marcador asociado a la disminución de anticuerpos o suero de convalecientes”, desarrolló el virólogo.

    Consultado sobre la diferencia en esa clasificación, variante de interés o de preocupación, desarrolló: “Cuando aparecen ciertas constelaciones de mutaciones que están asociadas a cambios biológicos del virus y en caso de generarse alguna información adicional epidemiológica que sugiera alguna diferencia significativa con respecto del resto del virus circulante, se empieza a hablar de variantes de interés”.

    “Sólo cuando se acumula información epidemiológica y fenotípica, especialmente experimental, que sustente aseveraciones de mayor transmisibilidad o escape inmune se habla de variantes de preocupación. En este momento según la Organización Mundial de la Salud existen en todo el mundo únicamente tres variantes que reúnen evidencia filogenética/genética, epidemiológica y fenotípica para clasificarlas como preocupantes: la de Reino Unido, la de Sudáfrica y la de Manaos, Brasil”

    Detección reciente en Córdoba

    Desde hace un mes, la Provincia de Córdoba realiza una vigilancia de los viajeros. “Se estudia el genoma del 100 por ciento de los casos positivos que vienen del exterior y acceden a realizarse el test”, aseguró Gabriela Barbás, secretaria de Promoción y Prevención de la Salud de Córdoba

    En ese sentido, Debat destacó la importancia de haber implementado a nivel provincial un sistema de vigilancia activa de detección de las nuevas variantes.

    Aunque no descartó la transmisión comunitaria de esas variantes, el investigador indicó que, de existir circulación comunitaria, estarían en baja frecuencia y no serían dominantes.

    Secuenciar

    Por su parte, Diego Ojeda, doctor en virología molecular e integrante del laboratorio de Andrea Gamarnik en la Fundación Instituto Leloir (FIL), explicó: “El secuenciado consta de purificar el material genético del virus a partir de los hisopados. cada vez que una persona da positivo a covid se puede determinar la carga viral y después almacenar para después hacer la secuenciación del virus”.

    “Se busca en esa secuencia si aparecen mutaciones nuevas; siempre se compara contra el virus que es el que surgió en Wuhan, China, que sería la cepa ancestral. Cada vez que aparecen variantes se las caracteriza y se publica. y si aparecen esas variantes en una combinación se las denomina una cepa”.

    Más allá del monitoreo en tiempo real que lleva adelante el proyecto Pais, todavía un interrogante le quita el sueño a los científicos del mundo: ¿Las vacunas son o serán eficaces frente a estas nuebas variantes del Covid?

    Qué significa el Pais
    En los últimos días de diciembre, cuando se conocieron los primeros reportes sobre una nueva variante del coronavirus que puso en estado de alerta el sistema de salud del Reino Unido y llevó a establecer restricciones estrictas en varios países del mundo (entre ellos, el nuestro) a viajeros provenientes de ese país, los investigadores del Proyecto Argentino Interinstitucional de Genómica de Sars-Cov-2 (Pais) se pusieron manos a la obra para desarrollar una estrategia que permitiera hacer monitoreo en tiempo real.

    Como objetivo general proponemos analizar la trayectoria evolutiva de las cepas del Sars-Cov-2 que circulan en Argentina para estudiar su origen y dispersión en el país, en el contexto de las cepas mundiales, como así también analizar las mutaciones que pudieran afectar el diagnóstico, la transmisión y la virulencia del virus. Para ello realizaron un muestreo en todo el país de aproximadamente 1000 genomas de Sars-Cov-2. Las muestras obtenidas son secuenciadas por NGS para obtener sus secuencias genómicas y así caracterizarlas.

    Fuente (Diario El Territorio)
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